Q 提取的外泌體RNA中有DNA污染?查看詳情
A外泌體裂解分相時,RNA在上層水相中,而DNA在中間層,轉(zhuǎn)移上層水相時,要注意不要吸到中間層,所以要保留部分水相,不要全吸取。
Q 提取的外泌體RNA下游應(yīng)用時,如RT-PCR不是很好?查看詳情
A洗脫的外泌體RNA中含有乙醇和/或較多鹽離子污染,會抑制PCR反應(yīng),所以,在最后洗滌時,將吸附柱置于室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的洗滌液。
Q 如何定量提取的外泌體RNA?查看詳情
A外泌體RNA含量較少(1-100 pg/μL ),所以,用常規(guī)定量RNA方法是很難的,并且不同樣本外泌體含量不同,含有的RNA量也不同,一般定量RNA方法有:
Bioanalyzer RNA Quantification kits;NanoDrop 2000;Quant-iT? RiboGreen? RNA Assay Kit;qPCR Standard Curve。
Q 為什么提取的外泌體RNA A260/280低于2.0?查看詳情
A大部分外泌體RNA是小RNA,且濃度很低,RNA的A260/280比值會隨RNA濃度降低而降低,正常A260/280比值在1.0-1.6之間,低的A260/280比值不會影響下游應(yīng)用。
Q 如果樣本的粘度過大該如何處理?查看詳情
A如果樣本粘度過大時,可以用1×PBS緩沖液進行等體積稀釋,將其混勻后再使用相應(yīng)的外泌體提取試劑進行外泌體提取。
Q 細(xì)胞培養(yǎng)上清中加入外泌體沉淀試劑并離心后,沒有出現(xiàn)沉淀,是哪里出的問題?查看詳情
A由于某些細(xì)胞中外泌體含量比較低,所以加了外泌體沉淀試劑之后肉眼可能無法觀察到沉淀,在重懸時使用 PBS 液朝離心管離心外側(cè)的內(nèi)壁反復(fù)吹打即可(避免劇烈吹打)。提取后的外泌體先進行BCA 蛋白定量檢測,再決定是否進行后繼實驗。